Рейтинг@Mail.ru
Поиск
x
Экспедиция «9 Легенд Русского Севера»
Наука

Микробиом московского метро оказался похож на нью-йоркский

14 февраля 2020
_-.jpg
Фото: news.weill.cornell.edu
Исследование прошло в рамках международного проекта по изучению микробных сообществ городских пространств.

На протяжении всей жизни мы постоянно окружены бактериями — помимо собственных, мы сталкиваемся с ними в воздухе, почве, воде и в наших домах. Некоторые из этих микроорганизмов могут быть вредными для человека, в то время как другие играют жизненно важную роль в регулировании иммунной системы.

С урбанизацией, охватывающей мир, ситуация меняется: люди по-прежнему окружены бактериями, но их разнообразие в настоящее время уменьшается, и наше взаимодействие с ними изменило характер.

Ученые из разных стран, объединившись в проекте MetaSUB, решили выяснить, как выглядит микробиота такой важной транспортной системы, как метрополитен. Исследователи начали с нью-йоркской подземки, а теперь изучили микробиом московского метро.

«Ученые исследовали поверхность пола, поручни, вагоны и обнаружили интересное разнообразие микробиоты», – Александр Тяхт, сотрудник международной лаборатории «Компьютерные технологии» Университета ИТМО.

Традиционным методом исследования микробиоты, живущей на различных поверхностях, является культивирование. Ученые берут мазок с пола, стены или поручня и высаживают собранные бактерии на чашку Петри, где они активно размножаются, и их становится проще изучать.

Однако такой метод имеет существенный недостаток: не зная, какие бактерии собраны, ученым сложно заранее выбрать подходящую среду для их культивации. В проекте MetaSUB исследователи использовали в качестве метода определения микробиомы высокопроизводительное ДНК-секвенирование.

«Наиболее представленные рода бактерий в Москве – Dietzia, Brevundimonas, Pseudomonas, Arsenicicoccus, Stenotrophomonas, Pseudomonas, Brevundimonas и Stenotrophomonas также были среди наиболее представленных в более раннем исследовании нью-йоркского метро. Получается, что в метро разных уголков мира одни и те же закономерности состава микробных сообществ», – Наталья Клименко, соавтор исследования.

Анализ не выявил свидетельств наличия патогенов: из 10 болезнетворных бактерий, ДНК которых могла быть выявлена точно при использованной методике, достоверно не было найдено ни одной. Тем не менее, подчеркивают ученые, это вовсе не значит, что руки после поручня эскалатора можно не мыть — образцов было обработано немного, проба способна обнаруживать не все патогены и не чувствительна к вирусам, грибам и простейшим.

Как подчеркивают ученые, данное исследование московского метро — лишь пилотный проект, который показывает, насколько успешно можно применять ДНК-секвенирование для изучения микробиоты общественных пространств. Для более полного исследования бактериального разнообразия метрополитена нужно проанализировать сотни проб на каждой станции, включив все возможные типы поверхностей. Пока это слишком дорого, но в будущем может стать реальностью.

Узнайте, почему люди так и не научились мыть руки.

рекомендации
Telegram

А вы знаете, что у нас есть канал в Телеграме? Подписывайтесь!

Звезда

Зоопарк внутри нас: микробиом человека

Замок

Недикий Запад: путешествие по русской Прибалтике

Вопросительный знак, вопрос

Как могли бы выглядеть объекты всемирного наследия ЮНЕСКО, если бы их восстановили